Beniko Nakajima er født i Tokyo i 1972. Hun har studeret klaver hos Keiko Kanazawa og Kazuoki Fujii ved Tohogakuen Musikkonservatorium i Tokyo og tog i 1995 diplomeksamen fra kammermusiklinjen. I løbet af studieårene 1991-95 deltog hun i flere masterclasses hos Theodore Paraskivesco, Jaque Rouvier og Franz Clidat.

Efter mange års engagement som akkompagnatør og kammermusiker i Japan blev Beniko Nakajima i 2005 optaget i solistklassen ved DKDM hos professor José Ribera (specialuddannelsen for pianister med kammermusik og akkompagnement). I 2006 vandt hun førstepris i DKDM’s legatkonkurrence. Hun har modtaget flere stipendier, Handlers legat samt Pianistinde Esther Vagnings Fond. I 2006 modtog hun desuden Bach-sponsorat. Hun har optrådt i Japan, Ungarn (Pecs), Polen (Krakow), Sverige og Danmark, både som akkompagnatør og kammermusiker. I efteråret 2007 optræder hun ved en kammermusikkoncert med musikere fra Helsingborg Symphony Orchestra (HSO) på Dunkers Kulturhus og ved Brahms Festival Copenhagen i Rundetårn. Hun akkompagnerer aktivt ved flere konkurrencer i Sverige og Danmark og assisterer desuden som orkesterpianist i HSO.